Ложноположительные результаты и мозаицизм в ПГТ

Истинная частота ложноположительных диагнозов, когда хромосомно нормальный эмбрион ошибочно определяется как аномальный, неизвестна. Согласно некоторым опубликованным отчетам, она может достигать 30% . Уровень так называемого мозаицизма в правильно функционирующей испытательной лаборатории PGT должен быть ниже 3%. 

Благодаря надежному культивированию эмбрионов до стадии бластоцисты, лазерной биопсии, витрификации и прогрессу в тестировании генетическая диагностика становится стандартом лечения. Тем не менее, важно понимать, что PGT не является диагностическим тестированием и не регулируется. Стандарты и правила диагностического тестирования применимы только к образцам, взятым у людей. ПГТ выполняется на образце биопсии, взятого у доимплантационного эмбриона на стадии, когда по закону человек не считается человеком. Таким образом, стандарты диагностического тестирования не применяются к PGT. Это просто неокончательный скрининг эмбрионов на наличие числовых хромосомных ошибок с более высокой вероятностью ошибиться, чем диагностическое тестирование. На первый взгляд, концепция PGT кажется простой: большинство неудач в наступлении беременности происходит из-за хромосомных ошибок эмбрионов. Само собой разумеется, что отсев хромосомно аномальных эмбрионов может повысить вероятность беременности. 

Тем не менее, специфичность PGT была поставлена ​​под сомнение из-за явно высокого уровня ложноположительных результатов, угрожающих подорвать всю идею хромосомного скрининга доимплантационных эмбрионов. Можно утверждать, что обычное использование термина «ложноположительный результат» неприменимо к PGT. Это связано с тем, что в рамках обычных лабораторных исследований «ложноположительный результат» подразумевает ошибку при тестировании образца. Утверждается, что с PGT практически нет ошибок в тестировании образцов, вместо этого говорится, что образец просто не представляет весь эмбрион.

Однако цель PGT не в том, чтобы определить, является ли образец, собранный для тестирования, нормальным, а в том, чтобы идентифицировать жизнеспособные эмбрионы. Следовательно, независимо от того, вызвана ли ошибка свойствами эмбриона (т.е. так называемым мозаицизмом), биопсией эмбриона или проблемами на аналитической фазе, она должна называться «ложноположительной» всякий раз, когда жизнеспособный эмбрион неправильно определены как нежизнеспособные.  

Эмбриональный мозаицизм 

На сегодняшний день ложноположительные ошибки почти полностью объясняются так называемым мозаицизмом. В свою очередь его можно объяснить внутренними свойствами эмбрионов, неадекватной стимуляцией или лабораторными протоколами ЭКО. Об этом свидетельствуют результаты нескольких исследований бластоцист, диагностированных как мозаичные, и недавнего большого расхождения в уровне «мозаицизма» между различными клиниками ЭКО . Однако сообщаемый уровень мозаицизма несовместим с частотой мозаицизма, обнаруженной у эмбрионов после имплантации. Кроме того, в обзоре Кабальбо и соавторов говорится,  что частота истинного (имеющего значение для развития) мозаицизма у доимплантационных эмбрионов не является основным фактором, способствующим ложноположительным результатам.

В хорошо управляемой испытательной лаборатории PGT частота мозаицизма должна быть ниже 3%, а частота трисомий и моносомий должна быть примерно такой же. Преобладание моносомии указывает на проблему на каком-то этапе тестирования.

Ниже приведен пример, демонстрирующий совокупный уровень мозаицизма 2,41% от компании ProgenesisЭто то, что можно было бы ожидать от авторитетной лаборатории PGT (у меня нет конфликта интересов, о котором я могу заявить здесь).

Progenesis (1)

Биопсия эмбриона

Небольшое количество клеток, собранных во время биопсии эмбриона, всегда было ограничивающим фактором специфичности PGT. Более того, обычно неизвестно, сколько ядерных клеток было предоставлено для тестирования. Это очень затрудняет интерпретацию значимости уровня мозаицизма, наблюдаемого после амплификации, и, следовательно, может стать источником ложноположительных результатов. Поскольку не существует стандартов обучения биопсии эмбриона, весьма вероятно, что количество клеток, предоставленных для тестирования, широко варьируется от одной лаборатории ЭКО к другой и может быть причиной наблюдаемых вариаций мозаицизма эмбрионов между лабораториями ЭКО, а также ложного впечатления о высоком преобладании «мозаицизма» в целом. 

Аналитический этап PGT

Поскольку очень небольшое количество эмбрионов, у которых диагностировано отклонение от нормы, повторно тестируется или переносится, прямая оценка ошибок на аналитической фазе невозможна. Тем не менее, косвенная оценка может быть выполнена путем сравнения соотношения трисомии к моносомии в референс-лабораториях PGT. Такая оценка полностью независима от мозаицизма, который не дает предпочтения в отношении потери или увеличения количества хромосом. Кроме того, поскольку каждая лаборатория PGT имеет большое количество лабораторий ЭКО, поставляющих образцы, это нивелирует любые различия в популяции пациентов, методах стимуляции, культивирования или биопсии.

Еще одно соображение, которое использовалось при разработке оценки, заключалось в том, что вероятность ошибок не зависит от каждой пары хромосом, и поэтому соотношение трисомии / моносомии необходимо анализировать отдельно для каждой отдельной пары хромосом. На основании имеющихся данных наибольшее расхождение было обнаружено для хромосомы 22 (наиболее часто встречается у доимплантационных эмбрионов) и хромосомы 9.

Приобретение или потеря 22-й хромосомы, обнаруженное во время тестирования PGS

 

Испытательная лаборатория PGT 1

Испытательная лаборатория PGT 2

Испытательная лаборатория PGT 3

Прирост

8%

2,7%

6%

Потеря

3,6%

4,6%

7%

Соотношение

2.2

0,6

0,85

p

<0,0001

<0,0001

N / S

Приобретение или потеря хромосомы 9, обнаруженное во время тестирования PGT

 

Испытательная лаборатория PGT 1

Испытательная лаборатория PGT 2

Испытательная лаборатория PGT 3

Прирост

0,76%

1,2%

1,4%

Потеря

1,1%

0,6%

0,9%

Соотношение

0,69

2.0

1.6

p

0,002

0,002

0,002

Приведенные выше данные показывают, что соотношение трисомий к моносомиям обратное для лабораторий в противоположных направлениях для разных пар хромосом. Тенденции невелики для каждой отдельной пары хромосом, но в совокупности они составляют значимый уровень. Таким образом, наш анализ указывает на аналитический этап PGS как на потенциальный источник значительных ошибок.

Заключение

Чувствительность PGT не вызывает сомнений. Это означает, что вероятность того, что аномальный эмбрион будет считаться нормальным, очень мала. Беспокоит то, что отсутствие стандартов при биопсии эмбриона и некоторые аналитические ошибки способствуют ложноположительным результатам. Другими словами, незначительное количество нормальных эмбрионов считается аномальным, что снижает ценность доимплантационного хромосомного скрининга.

Leave a Reply